SDS-PAGE膠配制及注意事項
SDS-PAGE(十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳)是一種基于大小分離蛋白質的常用技術。通過使蛋白質變性并賦予其均勻的負電荷,在電場作用下蛋白質向正極遷移,根據大小進行分離。本文將詳細介紹SDS-PAGE凝膠的配制方法及常見問題和解決對策。
一、 SDS-PAGE凝膠配制
*注意事項:
丙烯酰胺和雙丙烯酰胺是神經毒素,操作時應佩戴適當的個人防護裝備。總體積通常為10 mL,但可以根據需要調整。
過硫酸銨(APS)作為引發劑,與TEMED一起使用可以加速聚合反應。
緩沖液的體積會根據丙烯酰胺和雙丙烯酰胺的體積進行調整,以確保總體積的準確性。
這些配方是基于常用的分離膠濃度,具體實驗可能需要根據目標蛋白質的分子量范圍進行調整。
1. 分離膠配制
(1)配方表:
以下表格列出了不同濃度的分離膠的配方:
| 凝膠濃度 (%) | 水 (mL) | 30% 丙烯酰胺(mL) | 1.5 M Tris-HCl (pH 8.8) (mL) | 10% SDS (μL) | 10% APS (μL) | TEMED(μL) |
| 6% | 3.3 | 2 | 1 | 50 | 50 | 5 |
| 8% | 4.6 | 2.6 | 1 | 100 | 100 | 10 |
| 10% | 3.8 | 3.4 | 1 | 100 | 100 | 10 |
| 12% | 3.2 | 4 | 1 | 100 | 100 | 10 |
| 15% | 2.2 | 5 | 1 | 100 | 100 | 10 |
(2)配制步驟:
1. 清潔玻璃板和墊片:
? 使用去離子水和乙醇徹底清潔玻璃板和墊片,確保沒有殘留物。
2. 組裝玻璃板:
? 使用墊片將玻璃板組裝在穩定、均勻的表面上,確保組裝緊鎖夾子,檢查玻璃板完好性。
3. 配制分離膠溶液:
? 在干燥、干凈的燒杯中按照配方表中的比例混合水、30%丙烯酰胺、1.5 M Tris-HCl (pH 8.8)、10% SDS、10% APS 和 TEMED。TEMED必須是最后 加入的成分。
? 攪拌均勻后,立即倒入組裝好的玻璃板中,確保均勻分布。
? 用水或異丙醇覆蓋凝膠表面,以保持均勻的表面,室溫下凝固約 20-30 分鐘。
2. 濃縮膠配制
(1)配方表:
以下表格列出了濃縮膠的配方:
| 凝膠濃度 (%) | 水 (mL) | 30% 丙烯酰胺 (mL) | 0.5 M Tris-HCl (pH 6.8) (mL) | 10% SDS (μL) | 10% APS (μL) | TEMED (μL) |
| 4% | 6.14 | 1.06 | 3.3 | 100 | 100 | 10 |
| 5% | 5.86 | 1.34 | 2.6 | 100 | 100 | 10 |
| 6% | 5.28 | 1.72 | 3 | 100 | 100 | 10 |
(2)配制步驟:
1. 清潔玻璃板和墊片:
? 使用去離子水和乙醇徹底清潔玻璃板和墊片,確保沒有殘留物。
2. 組裝玻璃板:
? 使用墊片將玻璃板組裝在穩定、均勻的表面上,確保組裝緊鎖夾子,檢查玻璃板完好性。
3. 配制濃縮膠溶液:
? 在干燥、干凈的燒杯中按照配方表中的比例混合水、30%丙烯酰胺、0.5 M Tris-HCl (pH 6.8)、10% SDS、10% APS 和 TEMED。TEMED必須是最 后加入的成分。
? 攪拌均勻后,立即倒入組裝好的玻璃板中,確保均勻分布。
? 用水或異丙醇覆蓋凝膠表面,以保持均勻的表面,室溫下凝固約 20-30 分鐘。

二、 可能出現的問題及解決方案
在SDS-PAGE凝膠制備過程中,可能會遇到各種問題。以下是一些常見問題及其解決方案:
1. 漏膠問題:
? 原因:玻璃板未對齊或缺損,墊片密閉性不良。
? 解決方案:確保玻璃板干燥,對齊后緊鎖夾子,檢查玻璃板完好性。
2. 凝膠不凝固:
? 原因:APS或TEMED失效,操作不當。
? 解決方案:使用新鮮APS,確保TEMED未變質,避免膠未凝固前晃動。
3. 凝膠凝固不均勻:
? 原因:玻璃板未洗凈,試劑有沉淀,混合不均勻。
? 解決方案:徹底清洗玻璃板,確保試劑澄清透明,均勻混合組分。
4. 凝膠中有氣泡:
? 原因:膠墊材質問題,插梳子不當。
? 解決方案:使用實心軟膠墊或保鮮膜,正確插入梳子。
5. 上層膠邊緣缺損:
? 原因:玻璃板邊條密閉性不良。
? 解決方案:檢查并更換邊條,確保其密閉性。
6. 拔梳子后泳道有膠絲:
? 原因:TEMED 用量過多。
? 解決方案:減少TEMED用量,確保在插梳子前膠未部分凝固。
7. 拔梳子后泳道歪斜:
? 原因:梳子與玻璃板不匹配。
? 解決方案:確保梳子與玻璃板匹配,必要時更換。
8. 上層膠中電泳出現“漏樣”:
? 原因:玻璃板與膠局部分離,上樣緩沖液問題。
? 解決方案:小心取下玻璃板,避免分離,上樣時避免槍頭插得太深。
9. 泳道中心凹陷:
? 原因:梳子插入后膠暴露于空氣中時間過長。
? 解決方案:盡量在 25 分鐘內插入梳子,避免長時間暴露。
結語
通過詳細了解SDS-PAGE凝膠的配制方法及常見問題的解決方案,實驗者可以有效提高實驗成功率,減少誤操作,從而獲得高質量的實驗結果。一塊優質的SDS-PAGE膠能打好蛋白質電泳的基礎,從而跑出清晰好看的條帶,獲得優質的實驗結果。
