1、濃縮膠：在不連續聚丙烯 酰胺凝膠電泳中，同一介質的凝膠濃度分為 兩種，負極的加樣側一般濃度為2%?5%。

2、分離膠：不連續緩沖體系聚丙烯酰胺凝膠電泳中的一部分，其組成、緩沖液pH和凝膠孔徑與濃縮凝膠不同。它具有分子篩效應的小孔徑凝膠。

二、過程不同

1、濃縮膠過程：由于濃縮膠濃度低、孔徑大，分離膠濃度高，孔徑小。帶電蛋白質或核酸離子在大孔徑凝膠中運動時，阻力小，運動速度快。當接近小孔徑凝膠時，阻力較大，移動速度減慢，使樣品濃縮，形成窄帶，減少電泳過程中的帶擴散。

2、分離膠過程：蛋白質或核酸在電泳過程中由濃縮膠進入分離膠，由于分子篩的作用，小分子物質容易通過，阻力小，遷移速度快。大分子由于較大的電阻而滯后。因此，即使具有類似凈電荷和相等的游泳率的物質，也會根據分子量的不同而通過分子篩效應從凝膠中分離出來。